中科院计算所“生物信息课题组”招生信息
有意向的学生请发送简历至wanxiaohua@ict.ac.cn，也可联系电话010-62600881。
导师介绍
刘志勇 研究员 博导 计算机算法，体系结构，并行处理，互联网络，生物信息学
张 法 研究员 博导 高性能计算，生物信息学
万晓华 副研究员 硕导 生物信息、高性能计算、图像处理
任 菲 助理研究员 – – 医学图像处理
研究方向
科研项目情况
- 生物大分子冷冻电镜数据高效能处理的关键技术，国家自然科学基金重点基金项目，2020.1-2024.12
- 中医智能辅助诊疗系统，横向，2020.3.17-2021.1.17
- “地球大数据科学过程”项目二，大数据计算与处理系统研发，中科院A类战略先导科技专项 2018-2022
- 面向深度学习的GPU虚拟化关键方法与技术研究，北京市自然科学基金-海淀原始创新联合基金，2018-2021
- 基于关联敏感度的数据隐私分析与防护方法研究，国家重点研发计划（子课题），2018.01-2021.06
- 人工智能在数字病理分析中的应用研究，北京大学国际医院院内科研基金重点课题（子课题），2018.11-2020.10
- 人工智能数字病理图像处理关键技术及系统，横向，2019.06.16-2021.06.15
- 基于DNA自组装的纳米载药系统研究，国家重点研发计划（中美政府间合作项目），2018-2021
- 边缘计算基础理论与关键技术，国家自然科学基金NSFC-DFG(中德)项目， 2018.1—2020.12
- 高性能云计算数据中心关键技术与装备，国家重点研发计划， 2017.10 – 2021.9
- 蛋白质机器的高分辨率冷冻电镜前沿技术及应用，国家重点研发计划， 2017.7 – 2022.6
- 面向典型疾病的高精度生物大分子三维结构研究，国家自然科学基金–广东联合基金，重点项目， 2017.1 – 2020.12
- 基于天河二号的生物医学健康大数据应用支撑平台，国家自然科学基金–广东联合基金，重点项目， 2017.1 – 2020.12
- 面向高通量冷冻电镜图像的电子断层重构算法研究，国家自然科学基金，面上项目，2017.01-2020.12
- 高精度冷冻电镜三维重构算法研究与软件研制， 中国科学院计算技术研究所创新课题， 2016.4-2018.12
- 高效能数据中心 — 数据中心资源的优化组织与调度，国家自然科学基金，国际合作重点项目，2016.1-2020.12
- 高效能数据中心 – 数据中心资源的优化组织与调度，国家自然科学基金，国际合作重点项目， 2016.1 – 2020.12
- 生物显微投影图像的自动对位算法研究，国家自然科学基金，青年基金，2016.1 – 2018.12
- 超并行高效能计算机体系结构与设计方法研究，国家自然科学基金，创新群体基金，2010.1-2012.12,2013.1-2015.12,2016.1-2018.12
- 超级计算科学应用研究专项，国家自然科学基金-广东联合基金（第二期），2015.12—2017.12
- 面向大尺度生物图像的高精度三维分子结构重构技术研究，国家自然科学基金，面上项目，2015.1-2018.12
- 国家自然科学基金十三五信息化规划战略研究， 国家自然科学基金，应急管理项目，2014.8-2015.7
- 超大分子复合体的三维重构技术，中国科学院战略性科技先导专项（B类），2014.1-2018.12
- 面向复杂生物数据处理的高效计算方法，国家自然科学基金重点基金项目，2013.1-2017.12
- 面向高分辨的电子断层三维重构算法研究，国家自然科学基金青年基金项目，2013.1-2015.12
- 大规模数据中心的功耗最小化和资源利用最大化，国家自然科学基金委与香港研究资助局联合基金，2012.1-2014.12
- Biokepler，美国国家自然科学基金项目，2011.1-2014.12
- 绿色网络-降低网络能耗的理论与技术，国家自然科学基金，重大国际合作项目，2011.1-2014.12
- 生物信息学示范应用，国家自然科学基金重点项目（滚动支持），2010.1-2011.4
- 冷冻电镜二维图像处理方法与三维重构研究，中科院知识创新工程重大项目，2008.9-2011.12
- 生物信息学研究和应用，国家自然科学基金重点项目， 2008.9-2009.12
- 高性能片上存储系统，国家自然科学基金，重点项目，2008.1-2011.12
- 苏州吉玛基因药物科技有限公司联合课题“SiRNA软件设计分析”，2008.1-2010.12
- 高性能算法设计与分析，国家自然科学基金， 2007.4-2009.3
- 需求工程——对复杂系统的软件工程的基础研究，国家973项目，2007.1-2011.12
- 生物信息学示范应用， 国家自然科学基金重点项目，2006.1-2009.12
- “蛋白质空间结构的同源建模及其并行化研究”， 国家自然科学基金面上项目，2006.1-2008.12
学生荣誉
樊莉亚，2009年中科院计算所所长特别奖，2010年朱月华奖
王功明， 2011年中科院计算所所长优秀奖
万晓华，2011年中科院计算所所长特别奖，2012年中科院院长优秀奖，2013年入选计算所“学术百星”，2015年入选中科院青年创新促进会
王林，2015年院长优秀奖，2014年中国科学院计算技术研究所夏培肃奖学金，2013年国家奖学金博士奖
韩仁敏，2015年中国科学院计算技术研究所夏培肃奖学金
徐帆，2015年度所长优秀奖，2016年中国科学院计算技术研究所所长特别奖学金
王有识，2015年所长优秀奖学金，2015年中国科学院大学优秀学生干部、三好学生，2016年中国科学院大学优秀学生干部、三好学生，2017年所长优秀奖学金，2017年中国科学院大学优秀学生干部、三好学生，2018年中国科学院大学一等学业奖学金
陈庾，2014年度曙光硕士生奖
郝语，2017-2018年三好学生荣誉称号，2018年高性能计算机研究中心优秀学生，2018年度所长优秀奖
石翔，2016年度中国科学院大学三好学生，2017年度中国科学院大学三好学生，2018年度国家留学基金委公派出国留学奖学金，2019年度曙光博士生奖学金
张恩泽，2018年中国科学院大学三好学生
王子豪，2021年获得中科院朱李月华优秀博士生奖学金，2020年获得中科院先导杯大奖赛优胜奖，2019年获得中科院计算所三好学生，2018年获得中科院计算所北纬优秀科研博士生奖，2017年获得中科院计算所三好学生
申泽南，2020 年中国科学院大学三好学生，2020 年中科院计算所虑得投资硕士生奖，2019 年中科院计算机体系结构国家重点实验室优秀学生
毕业去向
樊莉亚，2010年博士毕业，就职于IBM。
储琪，2011年硕士毕业，就职于西澳大学。
王功明，2012年博士毕业，就职于中国科学院生物物理研究所。
万晓华，2012年博士毕业，就职于中国科学院计算技术研究所。
侯晨颖，2012年硕士毕业，就职于LinkedIn。
王林，2015年博士毕业，就职于TU Darmstadt,Germany。
金锡波，2015年博士毕业，就职于华为公司。
时阳光，2016年博士毕业，就职于Technion – Israel Institute of Technology。
韩仁敏，2016年博士毕业，就职于中汇信息技术上海有限公司。
邹盼，2016年硕士毕业，就职于猿题库公司。
徐帆，2017年博士毕业，就职于普渡大学。
张明哲，2018年博士毕业，就职于中国科学院计算技术研究所。
周碧玉，2018年博士毕业，就职于中国科学院信息工程研究所。
陈庾，2018年博士毕业，就职于搜狗公司。
王有识，2019年博士毕业，就职于美团点评。
张静蓉，2019年博士毕业，就职于英伟达。
朱立发，2019年硕士毕业，就职于飞步科技。
石翔，2020年博士毕业，就职于华为公司。
Avinab Marahatta，2020年博士毕业，就职于中国科学院信息工程研究所。
张恩泽，2020年硕士毕业，就职于华为公司。
曹召宾，2020年硕士毕业，就职于商汤北京。
王子豪，2021年博士毕业，就职于华为公司。
申泽南，2021年硕士毕业，就职于腾讯科技
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